Forskningssamarbetet har alltid varit en hörnsten i samarbetet mellan universiteten runt Öresund.  Forskningen är fri och forskare finner samarbete där det är bäst att samarbeta för forskningens skull. Det innebär att gemensamma forskningsprojekt och samarbeten kommer och går. Forskningen är beroende av externa pengar. Konkurrensen om dessa pengar samt villkoren för dem styr forskningssamarbetet.

Det innebär att det inom ØU finns individuella samarbeten, forskningsprojekt som kommer och går samt fasta och ganska fasta nätverk eller strukturer, inom vilka forskningssamarbe­ten kan finnas och stimuleras. Det framgår av enkäter och utvärderingar att majoriteten av forskare känner sina kollegor på andra sidan och är välbekanta med deras forskningsprofiler. Här finns alltså en mycket stor potential för samlade större forskningsprogram. Vilka gemensamma forskningsprojekt som startas är beroende av möjligheterna för gemensam finansiering.

.